1.如果公司没有成立，发起人协议效力要大于公司章程，纠纷应按协议的约定处理。

（1）依据《公司法》第43条：有限责任公司设立时的股东可以签订设立协议，明确各自在公司设立过程中的权利和义务。

（2）依据《民法典》第465条第2款：依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。

2.如果公司已经成立，则公司章程的法律效力要大于发起人协议。当发起人协议内容与公司章程不一致时，应按公司章程的约定解决纠纷。

（1）依据《公司法》第30条第1款：申请设立公司，应当提交设立登记申请书、公司章程等文件，提交的相关材料应当真实、合法和有效。

（2）依据《公司法》第45条：设立有限责任公司，应当由股东共同制定公司章程。

（2）依据《民法典》第79条：设立营利法人应当依法制定法人章程。

3.发起人协议不是法律规定的必备文件，调整的是发起人在设立公司过程中的权利和义务关系，公司成立即意味着协议效力终止。

4.公司章程是设立公司的必要条件，公司一旦成立，章程即发生法律效力，直至公司终止。公司章程调整所有股东之间，包括原始股东和后加入的股东、股东与公司之间、公司的管理机构与公司之间的法律关系。