补缴社保不受两年时效限制。

最高人民法院行政法官专业会议纪要（七）明确，劳动保障行政部门依据《劳动保障监察条例》第二十条规定，以企业未依法缴纳社会保险费行为在2年内未被发现，也未被举报、投诉为由不再查处的，人民法院不予支持；

当事人请求履行上述查处职责，且能够提供相应材料初步证明企业存在未依法缴纳社会保险费用的，人民法院应当判决责令有关劳动保障行政部门履行相应职责。

人力资源社会保障部在对相关建议的答复中也指出，《劳动保障监察条例》第二十条规定的2年时效不能仅依照第一款，还需综合第二款判断，且《社会保险费征缴暂行条例》和《社会保险稽核办法》均未对清缴企业欠费问题设置追诉期，地方经办机构追缴历史欠费并未限定追诉期，经办机构接到超2年追诉期投诉后，一般也按程序受理。